Er löst nach Berichten vom Donnerstag den bisherigen Armeechef General Anupong Paochinda am 1. Oktober ab. Prayuth war ein führender Befürworter der Niederschlagung der wochenlangen Massenproteste im vergangenen April und Mai gegen die Regierung. Bei Zusammenstössen mit Sicherheitskräften waren dabei mindestens 91 Menschen ums Leben gekommen.
Prayuth gilt als strammer Royalist und Gegner des 2006 gestürzten Ministerpräsidenten Thaksin Shinawatra. Thaksin war anschliessend vor einer Verurteilung wegen Amtsmissbrauchs ins Exil geflüchtet. Er hatte die Demonstranten in Bangkok kräftig angeheizt und gilt als Erzfeind von Regierungschef Abhisit Vejjajiva.